Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP11P51784 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
USP11P51784 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP11P51784 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP11P51784 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP11P51784 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP11P51784 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP11P51784 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP11P51784 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP11P51784 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP11P51784 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP11P51784 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP11P51784 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP11P51784 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP11P51784 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP11P51784 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP11P51784 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP11P51784 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP11P51784 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP11P51784 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP11P51784 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP11P51784 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP11P51784 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
USP11P51784 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP11P51784 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP11P51784 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP11P51784 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP11P51784 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP11P51784 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP11P51784 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP11P51784 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP11P51784 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP11P51784 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP11P51784 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
USP11P51784 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP11P51784 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP11P51784 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP11P51784 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP11P51784 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP11P51784 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP11P51784 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP11P51784 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP11P51784 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP11P51784 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP11P51784 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP11P51784 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP11P51784 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP11P51784 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP11P51784 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP11P51784 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP11P51784 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP11P51784 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP11P51784 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP11P51784 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP11P51784 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP11P51784 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP11P51784 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP11P51784 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP11P51784 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP11P51784 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP11P51784 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP11P51784 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP11P51784 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP11P51784 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP11P51784 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP11P51784 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP11P51784 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP11P51784 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP11P51784 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP11P51784 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP11P51784 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP11P51784 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP11P51784 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP11P51784 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP11P51784 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP11P51784 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms