Protein–RNA interactions for Protein: P51665

PSMD7, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD7P51665 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD7P51665 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD7P51665 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD7P51665 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD7P51665 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PSMD7P51665 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PSMD7P51665 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PSMD7P51665 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms