Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTDSS1P48651 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PTDSS1P48651 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms