Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cdkn1bP46414 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn1bP46414 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms