Protein–RNA interactions for Protein: P45844

ABCG1, ATP-binding cassette sub-family G member 1, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCG1P45844 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ABCG1P45844 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ABCG1P45844 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCG1P45844 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms