Protein–RNA interactions for Protein: P42582

Nkx2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-5P42582 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Nkx2-5P42582 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nkx2-5P42582 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nkx2-5P42582 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms