Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRIA3P42263 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIA3P42263 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms