Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Mmp9P41245 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Mmp9P41245 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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