Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
COL15A1P39059 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
COL15A1P39059 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
COL15A1P39059 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.2 ms