Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk2P38575 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk2P38575 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk2P38575 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk2P38575 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Upk2P38575 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk2P38575 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk2P38575 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk2P38575 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Upk2P38575 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms