Protein–RNA interactions for Protein: P32067

Ssb, Lupus La protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SsbP32067 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SsbP32067 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SsbP32067 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SsbP32067 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SsbP32067 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SsbP32067 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SsbP32067 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SsbP32067 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SsbP32067 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SsbP32067 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SsbP32067 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SsbP32067 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SsbP32067 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SsbP32067 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SsbP32067 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SsbP32067 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SsbP32067 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SsbP32067 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SsbP32067 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SsbP32067 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SsbP32067 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SsbP32067 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SsbP32067 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SsbP32067 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SsbP32067 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SsbP32067 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SsbP32067 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SsbP32067 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SsbP32067 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SsbP32067 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SsbP32067 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SsbP32067 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SsbP32067 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SsbP32067 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SsbP32067 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SsbP32067 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SsbP32067 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SsbP32067 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SsbP32067 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SsbP32067 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SsbP32067 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SsbP32067 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SsbP32067 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SsbP32067 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SsbP32067 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SsbP32067 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms