Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tacr1P30548 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tacr1P30548 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tacr1P30548 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms