Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Xrcc6P23475 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Xrcc6P23475 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xrcc6P23475 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 165.3 ms