Protein–RNA interactions for Protein: P22528

SPRR1B, Cornifin-B, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1BP22528 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SPRR1BP22528 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SPRR1BP22528 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms