Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefhP19246 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NefhP19246 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NefhP19246 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NefhP19246 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NefhP19246 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NefhP19246 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NefhP19246 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NefhP19246 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NefhP19246 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NefhP19246 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NefhP19246 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NefhP19246 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NefhP19246 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NefhP19246 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NefhP19246 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NefhP19246 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NefhP19246 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NefhP19246 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NefhP19246 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NefhP19246 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NefhP19246 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NefhP19246 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NefhP19246 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NefhP19246 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NefhP19246 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NefhP19246 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NefhP19246 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NefhP19246 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NefhP19246 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NefhP19246 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NefhP19246 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefhP19246 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefhP19246 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefhP19246 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NefhP19246 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefhP19246 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefhP19246 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefhP19246 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NefhP19246 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefhP19246 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefhP19246 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefhP19246 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefhP19246 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefhP19246 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefhP19246 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefhP19246 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefhP19246 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NefhP19246 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefhP19246 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefhP19246 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefhP19246 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefhP19246 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefhP19246 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefhP19246 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefhP19246 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NefhP19246 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefhP19246 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefhP19246 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefhP19246 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
NefhP19246 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefhP19246 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefhP19246 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefhP19246 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NefhP19246 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
NefhP19246 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefhP19246 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefhP19246 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefhP19246 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NefhP19246 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefhP19246 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NefhP19246 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NefhP19246 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefhP19246 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefhP19246 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefhP19246 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NefhP19246 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefhP19246 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NefhP19246 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms