Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF35P13682 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ZNF35P13682 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms