Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BMP3P12645 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BMP3P12645 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BMP3P12645 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BMP3P12645 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BMP3P12645 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BMP3P12645 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BMP3P12645 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BMP3P12645 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BMP3P12645 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BMP3P12645 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BMP3P12645 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BMP3P12645 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BMP3P12645 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BMP3P12645 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BMP3P12645 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BMP3P12645 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BMP3P12645 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BMP3P12645 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BMP3P12645 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BMP3P12645 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BMP3P12645 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BMP3P12645 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BMP3P12645 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BMP3P12645 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BMP3P12645 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
BMP3P12645 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BMP3P12645 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BMP3P12645 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BMP3P12645 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BMP3P12645 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BMP3P12645 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BMP3P12645 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BMP3P12645 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BMP3P12645 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BMP3P12645 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BMP3P12645 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BMP3P12645 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BMP3P12645 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BMP3P12645 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BMP3P12645 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BMP3P12645 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BMP3P12645 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BMP3P12645 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BMP3P12645 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BMP3P12645 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BMP3P12645 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BMP3P12645 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BMP3P12645 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BMP3P12645 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BMP3P12645 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BMP3P12645 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BMP3P12645 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BMP3P12645 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BMP3P12645 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BMP3P12645 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BMP3P12645 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BMP3P12645 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BMP3P12645 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BMP3P12645 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BMP3P12645 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BMP3P12645 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BMP3P12645 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BMP3P12645 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BMP3P12645 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BMP3P12645 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BMP3P12645 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
BMP3P12645 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BMP3P12645 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BMP3P12645 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BMP3P12645 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms