Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prf1P10820 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prf1P10820 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prf1P10820 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Prf1P10820 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prf1P10820 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prf1P10820 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prf1P10820 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prf1P10820 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prf1P10820 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prf1P10820 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms