Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM10L2BP0DMW5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM10L2BP0DMW5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMIM10L2BP0DMW5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms