Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SETSIPP0DME0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SETSIPP0DME0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SETSIPP0DME0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms