Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ZNF888P0CJ79 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF888P0CJ79 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms