Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPP08247 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPP08247 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPP08247 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPP08247 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPP08247 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPP08247 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPP08247 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPP08247 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPP08247 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPP08247 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPP08247 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPP08247 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPP08247 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPP08247 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPP08247 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYPP08247 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYPP08247 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPP08247 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPP08247 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPP08247 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPP08247 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPP08247 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPP08247 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPP08247 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPP08247 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYPP08247 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYPP08247 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPP08247 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYPP08247 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPP08247 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPP08247 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPP08247 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPP08247 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPP08247 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPP08247 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPP08247 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPP08247 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYPP08247 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SYPP08247 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SYPP08247 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPP08247 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SYPP08247 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms