Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB1P08034 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB1P08034 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GJB1P08034 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB1P08034 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB1P08034 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GJB1P08034 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB1P08034 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB1P08034 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB1P08034 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB1P08034 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB1P08034 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB1P08034 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB1P08034 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB1P08034 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB1P08034 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB1P08034 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB1P08034 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB1P08034 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB1P08034 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB1P08034 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB1P08034 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB1P08034 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB1P08034 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB1P08034 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB1P08034 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB1P08034 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB1P08034 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB1P08034 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB1P08034 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB1P08034 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB1P08034 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB1P08034 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB1P08034 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB1P08034 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB1P08034 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
GJB1P08034 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB1P08034 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB1P08034 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB1P08034 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB1P08034 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB1P08034 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB1P08034 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB1P08034 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB1P08034 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB1P08034 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB1P08034 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB1P08034 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB1P08034 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB1P08034 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB1P08034 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB1P08034 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB1P08034 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB1P08034 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB1P08034 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB1P08034 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB1P08034 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB1P08034 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB1P08034 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB1P08034 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB1P08034 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB1P08034 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB1P08034 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB1P08034 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB1P08034 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB1P08034 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB1P08034 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB1P08034 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB1P08034 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB1P08034 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB1P08034 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms