Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01746 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01746 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01746 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01746 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01746 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01746 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01746 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01746 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01746 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01746 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01746 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01746 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01746 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01746 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01746 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01746 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01746 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01746 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01746 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01746 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01746 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01746 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01746 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01746 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01746 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01746 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01746 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01746 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01746 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01746 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01746 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01746 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01746 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01746 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01746 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01746 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01746 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01746 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01746 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01746 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01746 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01746 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01746 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01746 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01746 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01746 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms