Protein–RNA interactions for Protein: O95452

GJB6, Gap junction beta-6 protein, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB6O95452 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB6O95452 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB6O95452 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GJB6O95452 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GJB6O95452 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB6O95452 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB6O95452 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB6O95452 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB6O95452 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GJB6O95452 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB6O95452 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB6O95452 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB6O95452 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB6O95452 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB6O95452 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB6O95452 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB6O95452 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GJB6O95452 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GJB6O95452 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GJB6O95452 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GJB6O95452 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GJB6O95452 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB6O95452 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GJB6O95452 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB6O95452 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB6O95452 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB6O95452 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB6O95452 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB6O95452 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB6O95452 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GJB6O95452 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GJB6O95452 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms