Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Sypl2O89104 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sypl2O89104 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sypl2O89104 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms