Protein–RNA interactions for Protein: O88708

Orc4, Origin recognition complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Orc4O88708 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Orc4O88708 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Orc4O88708 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Orc4O88708 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Orc4O88708 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Orc4O88708 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Orc4O88708 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Orc4O88708 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms