Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Vamp4O70480 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Vamp4O70480 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vamp4O70480 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms