Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CTNSO60931 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTNSO60931 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTNSO60931 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNSO60931 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNSO60931 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNSO60931 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNSO60931 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNSO60931 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNSO60931 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTNSO60931 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTNSO60931 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTNSO60931 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNSO60931 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNSO60931 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNSO60931 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTNSO60931 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNSO60931 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNSO60931 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNSO60931 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNSO60931 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNSO60931 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNSO60931 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNSO60931 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTNSO60931 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTNSO60931 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNSO60931 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNSO60931 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNSO60931 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNSO60931 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNSO60931 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTNSO60931 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTNSO60931 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNSO60931 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNSO60931 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNSO60931 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTNSO60931 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms