Protein–RNA interactions for Protein: O60613

SELENOF, Selenoprotein F, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOFO60613 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SELENOFO60613 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SELENOFO60613 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms