Protein–RNA interactions for Protein: O35930

Gp1ba, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1baO35930 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gp1baO35930 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gp1baO35930 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gp1baO35930 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms