Protein–RNA interactions for Protein: O35551

Rabep1, Rab GTPase-binding effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabep1O35551 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rabep1O35551 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rabep1O35551 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rabep1O35551 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rabep1O35551 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rabep1O35551 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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