Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnf5O35445 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf5O35445 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms