Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2-ObO35424 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
H2-ObO35424 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-ObO35424 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms