Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Scarb2O35114 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Scarb2O35114 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Scarb2O35114 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Scarb2O35114 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Scarb2O35114 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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