Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtgisO35074 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtgisO35074 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtgisO35074 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtgisO35074 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtgisO35074 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtgisO35074 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgisO35074 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtgisO35074 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms