Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ACOX3O15254 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ACOX3O15254 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms