Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP290O15078 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP290O15078 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CEP290O15078 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CEP290O15078 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP290O15078 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP290O15078 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP290O15078 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CEP290O15078 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP290O15078 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP290O15078 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP290O15078 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP290O15078 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CEP290O15078 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP290O15078 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP290O15078 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP290O15078 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP290O15078 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP290O15078 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP290O15078 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP290O15078 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP290O15078 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP290O15078 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP290O15078 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CEP290O15078 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CEP290O15078 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP290O15078 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP290O15078 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP290O15078 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP290O15078 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP290O15078 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP290O15078 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CEP290O15078 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CEP290O15078 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP290O15078 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP290O15078 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP290O15078 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CEP290O15078 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP290O15078 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP290O15078 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP290O15078 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP290O15078 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP290O15078 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CEP290O15078 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CEP290O15078 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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