Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm21900J3QP38 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm21900J3QP38 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms