Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pabpc4lG5E8X2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pabpc4lG5E8X2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pabpc4lG5E8X2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms