Protein–RNA interactions for Protein: F7CNM6

1700056E22Rik, RIKEN cDNA 1700056E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700056E22RikF7CNM6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
1700056E22RikF7CNM6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700056E22RikF7CNM6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms