Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cdh18E9Q9Q6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Cdh18E9Q9Q6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Cdh18E9Q9Q6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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