Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL5

Prrt2, Proline-rich transmembrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt2E9PUL5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Prrt2E9PUL5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Prrt2E9PUL5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Prrt2E9PUL5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms