Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PROB1E7EW31 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PROB1E7EW31 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PROB1E7EW31 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms