Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Soga1E1U8D0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Soga1E1U8D0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Soga1E1U8D0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Soga1E1U8D0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms