Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nkx6-2D3Z4R4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms