Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc13D3YV10 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc13D3YV10 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms