Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Catsperg2C6KI89 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Catsperg2C6KI89 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Catsperg2C6KI89 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Catsperg2C6KI89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Catsperg2C6KI89 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Catsperg2C6KI89 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Catsperg2C6KI89 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Catsperg2C6KI89 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Catsperg2C6KI89 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Catsperg2C6KI89 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Catsperg2C6KI89 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms