Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ptprz1B9EKR1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ptprz1B9EKR1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.8 ms