Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tmf1B9EKI3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmf1B9EKI3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.53■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tmf1B9EKI3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms